Quante specie
Poche sono le conoscenze sui primi funghi comparsi sulla terra; probabilmente si trattava di organismi che si erano differenziati dai protisti. Da questi ebbero origine i primi funghi, le cui testimonianze fossili risalgono a circa 400 milioni di anni fa. Attualmente vengono riconosciute circa 100000 specie fungine e si stima che almeno 200000 siano ancora da identificare. Non sono ancora chiari i legami evolutivi tra le classi principali dei zigomiceti, ascomiceti e basidiomiceti, mentre in quella dei deuteromiceti sono state raggruppate tutte le specie nelle quali non è mai stato osservato alcun ciclo di riproduzione sessuata.
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